Le drapeau de l'Empire russe a été le drapeau officiel du Turkménistan jusqu'en 1914, puis pendant trois ans jusqu'en 1917, mais avec un dessin légèrement différent : les armoiries apparaissaient dans le coin supérieur gauche sur un fond jaune. Ensuite, jusqu'à l'effondrement de l'Union soviétique en 1991, le Turkménistan a utilisé diverses variantes de drapeaux similaires aux drapeaux soviétiques - une base rouge avec un croissant de lune, une étoile ou la faucille et le marteau.

Depuis 1937, le drapeau a un fond rouge uni avec une inscription dorée dans le coin supérieur gauche - TSSR. Depuis les années 1940, le drapeau n'a pas changé, mais l'abréviation a été écrite en cyrillique. En 1953, le drapeau a été redessiné, réintroduisant le marteau et la faucille et l'étoile à cinq branches au-dessus d'eux, ainsi que deux lignes bleues au milieu, le long du drapeau. Entre l'indépendance en 1991 et l'adoption du nouveau drapeau en février 1992, ce drapeau est resté le drapeau national du Turkménistan indépendant.
Après avoir obtenu son indépendance en 1991, le Turkménistan a adopté, le 19 février 1992, un drapeau très similaire à l'actuel. En 1997, deux branches d'olivier croisées ont été ajoutées pour symboliser la nature pacifique du peuple turkmène et son statut de neutralité permanente. En 2001, le rapport hauteur/largeur du drapeau est passé de 1:2 à 2:3.