La couleur blanche du drapeau du Qatar correspond à la couleur de la terre de la péninsule du Qatar, qui est constituée de calcaire d'un blanc éclatant, tandis que la couleur bordeaux symbolise les récifs coralliens qui entourent les côtes de la péninsule. La forme du drapeau, plus allongée que celle des autres drapeaux arabes ou internationaux, a été conçue pour une meilleure visibilité en mer. Dans la culture du Golfe et de la péninsule arabique, la couleur rouge dans les symboles maritimes représente les récifs coralliens vus par les pêcheurs en mer et les perles sous l'eau. La mer Rouge a été baptisée ainsi en raison des anciens drapeaux du Koweït, des Émirats et de Bahreïn, qui étaient rouge et blanc. Contrairement à la croyance populaire, la couleur blanche du drapeau qatari symbolise la terre et non la paix, tandis que la couleur bordeaux symbolise la mer et non le sang versé lors des guerres. On dit que les habitants du Qatar ont autrefois teint leurs drapeaux en rouge avec de la teinture provenant de l'île de Bin Ghannam, connue sous le nom d'île pourpre. À la suite d'une exposition prolongée au soleil, les couleurs de la teinture ont viré au bordeaux.
Les triangles sur le drapeau du Qatar symbolisent les vagues. Ces symboles figurent sur les drapeaux du Qatar et de Bahreïn parce qu'ils sont situés dans des eaux peu profondes et qu'ils aident à naviguer dans ces eaux. La forme triangulaire des drapeaux est due à la réfraction des petites vagues sur les plages et à la présence d'un courant parallèle au rivage. Les 9 triangles du drapeau du Qatar symbolisent le fait que le Qatar est le neuvième pays des Émirats à signer un accord de paix, et les 5 triangles du drapeau de Bahreïn font référence aux piliers de l'islam. Le principal symbole du drapeau qatari, d'un point de vue maritime, est le rivage ou la "sécurité". La couleur bordeaux représente la mer, qui semble ne pas avoir de fin, puis une plage blanche sur laquelle elle se brise. Les vagues étant triangulaires, la couleur bordeaux semble plus étendue que le blanc pour exprimer la largeur et la longueur de la mer. Il est fort probable que ce drapeau ait été utilisé comme guide pour les navires, leur indiquant qu'ils approchaient de la terre. Comme il n'y a pas de grands phares ni de relief visible dans la région, il était d'une grande importance pour la navigation des navires.