Les premiers Européens à avoir visité les Tonga furent les navigateurs néerlandais Jacob Lemaire et Willem Schouten en 1616, lors de leur voyage à travers l'océan Pacifique. Plus tard, en 1643, l'île a été visitée par un autre explorateur néerlandais, Abel Tasman, qui a rédigé les premiers documents officiels sur la région, bien que les contacts entre les Européens et les habitants aient été limités à l'époque. En 1773, l'explorateur britannique James Cook a visité les Tonga lors de sa deuxième expédition dans le Pacifique, puis en 1774 et 1777. Il a baptisé l'archipel les « îles de l'amitié » en raison de l'accueil chaleureux que lui ont réservé les habitants. Grâce aux explorateurs européens tels que Lemaire, Schouten, Tasman et Cook, les Tonga se sont fait connaître en dehors de l'Océanie, ce qui a ensuite contribué à l'établissement de contacts étroits avec le monde occidental et à l'émergence des premiers symboles étatiques.

Le premier roi des Tonga modernes est Tāufaʻahau I, baptisé Siaosi en l'honneur du roi George III de Grande-Bretagne. George Tupou Ier voulut créer un drapeau pour symboliser l'unité de son royaume. La pièce maîtresse du drapeau est constituée des lettres « M » (bleu) et « A » (rouge), censées symboliser le roi George Tupou Ier (son nom populaire est « Siaosi Taufaʻahau »). À gauche des lettres se trouvent deux croix bleues et à droite deux croix rouges, symbolisant respectivement le christianisme et le sacrifice, la lutte pour la foi et la royauté. Le drapeau était un symbole du règne du roi Tupou I sur l'île principale de Tonga, Tongatapu, pendant la période où il a tenté d'unifier le pays sous une administration unique, mais il a été remplacé en 1862.

Entre 1862 et 1866, les Tonga ont utilisé leur premier drapeau national officiel, approuvé par le roi George Tupou I. Ce drapeau était composé d'une croix rouge sur fond blanc, la croix symbolisant Jésus-Christ, la couleur rouge de son sang et la couleur blanche de la pureté et de la paix. Cependant, quelques années plus tard, en 1866, le drapeau fut modifié, George Tupou Ier continuant à adapter les symboles de l'État pour répondre à de nouveaux besoins et à de nouvelles attentes. Cette évolution est due à la consolidation du christianisme dans le pays, au renforcement des relations internationales et à la poursuite des réformes.
Le drapeau moderne des Tonga a été officiellement adopté le 4 novembre 1875. Il se compose d'un tissu rouge avec un carré blanc dans le coin supérieur gauche (canton), qui représente une croix rouge. Il est important de noter qu'en 1875, ce drapeau a été inscrit dans la constitution et que, selon les lois des Tonga, il ne peut être modifié. Les Tonga sont l'un des rares pays au monde où le drapeau national est resté inchangé pendant plus d'un siècle.