À l'origine, comme beaucoup d'autres colonies, les îles utilisaient différentes versions du drapeau britannique. Les premiers drapeaux étaient basés sur les drapeaux coloniaux britanniques standard, qui consistaient généralement en un Union Jack dans le coin supérieur gauche sur un champ bleu. Toutefois, comme les îles n'ont pas eu leurs propres armoiries avant le milieu du XXe siècle, leurs drapeaux n'étaient pas très distincts.
Cette situation a commencé à changer au milieu du XXe siècle, lorsque les colonies britanniques du monde entier ont reçu leurs propres armoiries et drapeaux afin de refléter leur identité et leur histoire uniques. En 1968, les îles Turks et Caicos ont approuvé une nouvelle constitution qui leur accordait l'autonomie, et avec elle un nouveau drapeau comprenant les armoiries des îles Turks et Caicos, situées sur un bouclier jaune. Les armoiries se composent de trois éléments principaux : un homard symbolisant la richesse des ressources marines, un coquillage représentant l'importance de la pêche et des fruits de mer pour l'économie, et un cactus reflétant la flore unique des îles.
L'apparition des armoiries sur le drapeau revêtait une grande importance symbolique pour les habitants des îles, car elle reflétait leur patrimoine culturel unique et la richesse de leurs ressources naturelles. Au fil des ans, le drapeau est resté inchangé malgré les changements politiques et administratifs survenus dans les îles. Il est devenu un important symbole d'identité nationale et de fierté pour les habitants des îles Turks et Caicos.