L'île Norfolk a été découverte par le capitaine James Cook en 1774 lors de sa deuxième expédition dans l'océan Pacifique. En 1788, les Britanniques en firent une colonie et y installèrent les premiers colons, des prisonniers et des soldats. Durant cette période, le drapeau de la Grande-Bretagne est utilisé sur l'île. En 1825, l'île a été repeuplée en tant que lieu de détention pour les criminels particulièrement dangereux, toujours sous le drapeau britannique.

Cette période s'est toutefois achevée au milieu du XIXe siècle avec la réinstallation des descendants des rebelles de Pitcairn à Norfolk. L'île de Pitcairn, l'une des îles habitées les plus reculées du monde, est devenue célèbre grâce à l'équipage du Bounty, qui s'est rebellé contre le capitaine William Bly. Les rebelles, menés par Fletcher Christian, ont échappé aux poursuivants britanniques et se sont installés sur l'île méconnue de Pitcairn en 1790. L'isolement de l'île leur a permis de se mettre à l'abri des autorités britanniques. Au fil du temps, cependant, la population a augmenté, entraînant une surpopulation, et en 1856, la plupart des descendants des rebelles se sont installés sur l'île de Norfolk. D'ailleurs, les descendants des Pitcairns vivent aujourd'hui sur l'île Norfolk.
En 1897, Norfolk a été transférée sous la juridiction de la Nouvelle-Galles du Sud, ce qui a conduit à l'utilisation de drapeaux coloniaux britanniques avec des signes régionaux caractéristiques de ce territoire. Ensuite, en 1914, l'île a été incorporée à l'Union australienne, et le drapeau national de l'Australie est devenu le drapeau officiel, qui a été utilisé jusqu'en 1980, puisque, contrairement à d'autres colonies, Norfolk n'avait pas de symboles propres jusqu'à cette date.

En 1980, Norfolk, en tant que territoire extérieur australien, a finalement reçu son propre drapeau, qui est devenu un symbole d'autonomie et de fierté locales. Le drapeau moderne se compose de deux bandes verticales vertes et d'une bande centrale blanche représentant le célèbre pin de l'île Norfolk.